Рефераты. Аллельные варианты генов-кандидатов подверженности туберкулезу у русского населения Западной Сибири

Известно, что у жителей Тувы больных туберкулезом выявлено отклонение от РХВ для полиморфизмов 1465-85G/A и D543N гена NRAMP1 за счет пониженного количества гетерозигот в обоих случаях и для полиморфизмов B/b и F/f гена VDR за счет повышенной гетерозиготности [Рудко А.А., 2004]. Таким образом, как для русских, так и для тувинцев, больных туберкулезом, характерно повышенное количество гетерозигот B/b гена VDR. Сравнение частот аллелей и генотипов у русских и тувинцев, больных туберкулезом, показало статистически значимые отличия для всех исследованных полиморфных маркеров (табл. 11). Максимальная степень отличий частот аллелей и генотипов показана для полиморфизма B/b гена VDR.


Таблица 10 Частоты аллелей и генотипов исследованных полиморфизмов у больных туберкулезом

Ген

Поли-морфизм

Гено-типы

N.O.

N.E.

Частота аллеля

χ2 (d.f.)

Hobs

Hexp

D

NRAMP1

469+14 G/C

GG GC CC

179 94 6

183,07 85,86 10,07

G= 0,810

2,25 (1)

0,337

0,308

+0,095


D543N

DD DN NN

263 14 1

262,23 15,54 0,23

D= 0,971

1,28  (1)

0,050

0,056

-0,099


1465-85 G/A

GG GA AA

126 126 27

128,03 121,94 29,03

G= 0,677

0,25 (1)

0,452

0,437

+0,033


274C/T

CC CT TT

163 122 14

167,82 112,37 18,81

C= 0,749

2,01  (1)

0,408

0,376

+0,086

IL12B

1188 A/C

AA AC CC

162 100 17

161,09 101,82 16,09

A= 0,760

0,05 (1)

0,358

0,365

-0,018

VDR

B/b

BB Bb bb

49 168 76

60,37 145,26 87,37

b= 0,546

6,95* (1)

0,573

0,496

+0,157


F/f

FF Ff ff

124 134 40

122,42 137,16 38,42

F= 0,641

0,12 (1)

0,450

0,460

-0,023

IL1B

+3953 A1/A2

A1A1 A1A2 A2A2

169 108 24

165,21 115,57 20,22

A1 0,741

1,16 (1)

0,359

0,384

-0,066

IL1RN

VNTR

A1A1 A1A2 A1A3 A1A4 A2A2 A2A3 другие

158 100 10 1 25 4 1

152,43 110,16 11,53 0,43 19,90 4,17 0,38

A1= 0,714 A2= 0,258 A3= 0,027

6,35 (6)

0,385

0,422

-0,088


Примечание. Обозначения см. табл. 6


Таблица 11 Сравнение частот аллелей и генотипов у русских и тувинцев с ТБ

Полимор-физм

Гено-типы

Частоты (%)

p

Ал-лели

Частоты

p



русские

тувинцы



русские

тувинцы


NRAMP1

469+14 G/C

GG GC CC

179 (64,2) 94 (33,7) 6 (2,1)

198 (85) 32 (13,7) 3 (1,3)

0,000

G

0,810

0,918

0,000

D543N

DD DN NN

263 (94,6) 14 (5) 1 (0,4)

191 (80,9) 39 (16,5) 6 (2,6)

0,000

D

0,971

0,892

 0,000

1465-85G/A

GG GA AA

126 (45,2) 126 (45,2) 27 (9,6)

153 (65,7) 63 (27) 17 (7,3)

0,000

G

0,677

0,794

0,000

274C/T

CC CT TT

163 (54,5) 122 (40,8) 14 (4,7)

190 (80,5) 45 (19,1) 1 (0,4)

0,000

C

0,749

0,900

0,000

IL12B

1188 A/C

AA AC CC

162 (58) 100 (35,8) 17 (6,2)

90 (38,6) 102 (43,8) 41 (17,6)

0,000

A

0,760

0,605

0,000

VDR

B/b

BB Bb bb

49 (16,7) 168 (57,3) 76 (26)

3 (1,3) 82 (35) 149 (63,7)

0,000

b

0,546

0,812

0,000

F/f

FF Ff ff

124 (41,6) 134 (45) 40 (13,4)

125 (53,6) 102 (43,8) 6 (2,6)

0,000

F

0,641

0,755

0,000

IL1B

+3953 A1/A2

A1A1 A1A2 A2A2

169 (56,1) 108 (35,9) 24 (8)

185 (79,1) 47 (20) 2 (0,9)

0,000

A1

0,741

0,891

0,000


Примечание. р - достигнутый уровень значимости при сравнении частот аллелей и генотипов


У русских с ТБ и здоровых по сравнению с жителями Тувы чаще наблюдали гомозиготный по аллелею В и гетерозиготный генотипы. Среди жителей г. Томска, больных туберкулезом, по сравнению с тувинцами статистически значимо чаще встретились аллели 469+14C, 1465-85A, 274T гена NRAMP1, f гена VDR, и +3953А2 гена IL1В, реже регистрировались аллели 543N гена NRAMP1 и 1188С гена IL12B. В целом можно отметить, что отличия в распределении генотипов и аллелей между русскими и тувинцами были идентичными у больных и здоровых: у русских с туберкулезом преобладали те же аллели генов, что и у здоровых.

При сравнении распределений генотипов и частот аллелей в выборках больных и здоровых лиц, живущих в г. Томске и Томской области, выявлены статистически значимые отличия для полиморфизма 274С/Т гена NRAMP1 и трех генов, принимающих участие в продукции интерлейкинов (табл. 12). Так, у больных туберкулезом статистически значимо чаще регистрировался гетерозиготный генотип 274С/Т гена NRAMP1 (OR=1,66, 95%CI:1,02-2,71; p=0,040). Лица, обладающие гомозиготным генотипом 274С/C чаще встречались среди здоровых (OR=0,54, 95%CI:0,33-0,87; р=0,010). Показаны отличия частот аллелей у больных и здоровых для полиморфизма +3953 А1/А2 гена IL1B (p=0,036) за счет повышения доли аллеля А2 у больных туберкулезом. В тоже время, не найдено отличий при сравнении распределения генотипов этого полиморфизма гена IL1В (табл. 12).

Страницы: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20



2012 © Все права защищены
При использовании материалов активная ссылка на источник обязательна.